赣州市第五人民医院始建于1955年，前身是赣南行署结核病防治所，现已发展成为一所集医疗、教学、科研、康复为一体的三级甲等公立医院。赣州市第五人民医院于2006年批准成立，2008年11月挂牌运行，同时挂牌赣南医学院附属赣州市第五人民医院、赣州市肝病医院、赣州市肺科医院、赣州市传染病医院，实行五块牌子一套人马，是以肝病、肺病、职业病、传染病治疗为特色的品牌专科型综合医院，是赣南医学院第九临床医学院、赣南卫生健康职业学院教学医院。
赣州市第五人民医院承担了全市重大突发公共卫生事件、突发传染病、肝病、肺病、职业病的医疗救治工作，是市中心城区及各县（市）转诊传染病病人的集中收治医院，并负责全市医疗机构的艾滋病、结核病、肝病等法定传染性疾病的培训、会诊、业务指导等工作任务，同时承担了城西片区居民的医疗保健工作和医疗急救工作任务。
赣州市第五人民医院分为南院和北院，占地面积148亩，是一座环境园林化、设施宾馆化的现代化医院。南院位于市文明大道31号；北院位于章贡区水西镇赤珠105国道旁。全院开放床位600张，设有9间层流手术室（其中2间负压手术室）、9张ICU病床（其中2张负压病床）。现有在岗职工总数502人，其中博士、硕士20余名，本科以上学历占72%；高级职称16人，中级职称155人。
赣州市第五人民医院拥有赣州市肝病、肺病重点专科及PCR、耐药基因检测、艾滋病等重点专科实验室；有省市共建学科1个，市级医学领先学科2个；设有赣州市肝病研究所和赣州市呼吸病防治研究所，是中国医院协会感染病医院管理分会会员单位、江西省传染病学专业委员会委员单位、赣州市医学会感染病学、肝病、结核病、呼吸内镜专业委员会、感染病专业护理学委员会主任委员单位，是北京佑安医院联盟医院，也是中山大学第三附属医院、广东省人民医院、广州市呼吸病研究所、上海市肺科医院、福建医科大学孟超肝胆医院、江西省胸科医院、南昌市第九医院的协作医院。
赣州市第五人民医院主要科室设置：肝病科（4个病区）、结核科（3个病区）、呼吸与危重症医学科（3个病区）、感染科、胸外科、肝胆外科、创伤外科(骨科、神经外科)、重症医学部（ICU和急诊科）、妇产科、儿科、中医科、五官科、口腔科等临床科室，以及检验科、影像介入科、功能科、药剂科、体检科等辅助科室。设有肝病、肺病和结核病治疗中心，并成立了人工肝、内镜和介入治疗中心。
主要医疗设备： GE磁共振（
